土壤中的氨基酸，能夠作為微生物的氮素來源，從而促使作物根部產生大量微生物菌群，而這些菌群不僅具有活化土壤養分的作用，同時其分泌的有機物還能改善土壤理化性狀，促進土壤團粒機構的形成，從而提高土壤保水保肥能力，利于作物根系生長。

氨基酸水溶肥可以與大多數農藥、肥料、調節劑混合使用，且混用后農藥藥效、肥料肥效更好，因此，在農業生產中無需單獨耗費人工施用，節約種植成本。